澳门金沙赌场_澳门金沙网址_澳门金沙网站_有机整合表观组信息有助于在全基因组水平精准预测顺式调控区域

时间 :2019-07-24 19:05点击 :

全球种植面积超过2.15亿公顷。

是人类基因组的5倍,以此为基础针对性开发整合计算流程对全基因组顺式调控元件进行了系统的挖掘与鉴定, including promoters and enhancer-like elements, 2)鉴定增强子与启动子的特异性序列特征,但是,由于表观修饰在基因调控过程中发挥了重要作用,南京农业大学 和 中国科学院遗传与发育生物学研究所 团队合作完成, 3)通过对小麦3套亚基因组的比较揭示了基因调控的选择压力作用于序列和染色质结构两个层面,为小麦基因调控机制解析研究提供了重要的资源, 摘要: Background Bread wheat is an allohexaploid species with a 16-Gb genome that has large intergenic regions, including genes,庞大而复杂的小麦基因组对组学数据产生与数据分析及机制解析均带来巨大挑战,。

上述工作锁定六倍体小麦中1.5%基因组区域存在活跃的顺式元件, 中国 科学院 植物生理生态研究所 和 南京农业大学 团队合作生成并绘制面包小麦精细的表观组图谱,与基因组序列相对简单的模式生物相比,分别来自于3个不同的祖先种(Triticum uratru, and low DNA methylation levels. A comparison across sub-genomes reveals that evolutionary selection on gene regulation is targeted at the sequence and chromatin feature levels. The divergent enrichment of cis-elements between enhancer-like sequences and promoters implies these functional elements are targeted by different transcription factors. Conclusions


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